Antropolojik saha araştırması kapsamında Kamerun'da Fang topluluğu üzerine çalışmış, bu süreçte topluluğun geleneksel dinini ve epik anlatılarının aktarımını incelemiştir. Araştırmaları kültürel bilgi ve inançların yayılışını anlamaya yönelik bilişsel çerçevesini geliştirmesine zemin oluşturmuştur. İleriki çalışmalarında, kültürel aktarımı mümkün kılan bilişsel mekanizmaları deneysel yöntemlerle incelemiş; özellikle doğaüstü kavramların hafızada tutulması ve dini inançların iletilmesinde yer alan bilişsel süreçlere odaklanmıştır. Boyer, insan evriminin sosyal ilişkileri, kültürü ve dini inançlara yönelik tutumları şekillendiren bilişsel mekanizmaları geliştirdiğini savunur. Boyer'e göre, bu mekanizmalar sayesinde dini temalar –ruhlar, hayaletler, atalar, tanrılar vb.– toplum içinde kolaylıkla aktarılabilir. Dini inançlar metafizik kaygılardan ziyade insan zihninin doğal bilişsel kapasitesinin sonucudur. Boyer görüşlerini yaşam, ölüm ve toplumsal etkileşimler gibi alanlarda belirli nöronal aktivitelerle ilişkilendiren bilimsel bulgularla destekler.
Boyer'in eserleri arasında Dinin Açıklanması (Religion Explained), The Naturalness of Religious Ideas, Minds Make Societies yer alır.